Στον 6ο όμιλο του Europa League κληρώθηκε ο Ολυμπιακός με αντιπάλους τις Μίλαν (Ιταλία), Μπέτις (Ισπανία), Ντουντελάνζ (Λουξεμβούργο). 
Στον 12ο όμιλο του Europa League κληρώθηκε ο ΠΑΟΚ με αντιπάλους Τσέλσι (Αγγλία), Μπάτε Μπόρισοφ (Λευκορωσία), Βίντι (Ουγγαρία).
 Οι ημερομηνίες των έξι αγωνιστικών: 
1η Αγωνιστική: 20 Σεπτεμβρίου 
2η Αγωνιστική: 4 Οκτωβρίου 
3η Αγωνιστική: 25 Οκτωβρίου 
4η Αγωνιστική: 8 Νοεμβρίου 
5η Αγωνιστική: 29 Νοεμβρίου 
6η Αγωνιστική: 13 Δεκεμβρίου 
Οι 12 όμιλοι της αγωνιστικής περιόδου 2018-19 στο Europa League, όπως προέκυψαν μετά από την κλήρωση που πραγματοποιήθηκε στο Μονακό, έχουν ως εξής:
1ος όμιλος
Λεβερκούζεν (Γερμανία)
Λουντογκόρετς (Βουλγαρία)
Ζυρίχη (Ελβετία)
ΑΕΚ Λάρνακας (Κύπρος)
2ος όμιλος
Σάλτσμπουργκ (Αυστρία)
Σέλτικ (Σκωτία)
Λειψία (Γερμανία)
Ρόζενμποργκ (Νορβηγία)
3ος όμιλος
Ζενίτ Αγίας Πετρούπολης (Ρωσία)
Κοπεγχάγη (Δανία)
Μπορντό (Γαλλία)
Σλάβια Πράγας (Τσεχία)
4ος όμιλος
Άντερλεχτ (Βέλγιο)
Φενερμπαχτσέ (Τουρκία)
Ντιναμό Ζάγκρεμπ (Κροατία)
Σπαρτάκ Τρνάβα (Σλοβακία)
5ος όμιλος
Άρσεναλ (Αγγλία)
Σπόρτινγκ Λισαβόνας (Πορτογαλία)
Καραμπάχ (Αζερμπαϊτζάν)
Βόρσκλα (Ουκρανία)
6ος όμιλος
Ολυμπιακός (ΕΛΛΑΔΑ)
Μίλαν (Ιταλία)
Μπέτις (Ισπανία)
Ντουντελάνζ (Λουξεμβούργο)
7ος όμιλος
Βιγιαρεάλ (Ισπανία)
Ραπίντ Βιέννης (Αυστρία)
Σπαρτάκ Μόσχας (Ρωσία)
Ρέιντζερς (Σκωτία)
8ος όμιλος
Λάτσιο (Ιταλία)
Μαρσέιγ (Γαλλία)
Αϊντραχτ Φρανκφούρτης (Γερμανία)
Απόλλων Λεμεσού (Κύπρος)
9ος όμιλος
Μπεσίκτας (Τουρκία)
Γκενκ (Βέλγιο)
Μάλμε (Σουηδία)
Σάρπσμποργκ (Νορβηγία)
10ος όμιλος
Σεβίλη (Ισπανία)
Κράσνονταρ (Ρωσία)
Σταντάρ Λιέγης (Βέλγιο)
Ακχισαρσπόρ (Τουρκία)
11ος όμιλος
Ντιναμό Κιέβου (Ουκρανία)
Αστάνα (Καζακστάν)
Ρεν (Γαλλία)
Γιάμπλονετς (Τσεχία)
12ος όμιλος
Τσέλσι (Αγγλία)
ΠΑΟΚ (ΕΛΛΑΔΑ)
ΜΠΑΤΕ Μπορίσοφ (Λευκορωσία)
Βίντι (Ουγγαρία)